机构债券是指由政府所有并经营管理或者由政府发起但由私人机构发行的债务工具。

机构债券按照其对政府依托的水平区别，对投入者有区别的价值。机构债券对政府的依托程度主要分四类：得到政府完全保证和信用依托的债券；由财政部担保的债券；拥有从财政部借款优先权的机构发行的债券；没有明确的政府支持，但拥有对政府支持的某些要求权的机构发行的债券。

机构债券的发行主体中的国内机构，如各国扶持农业的农业信贷系统、国家重点项目基金、学生贷款协会、各种政策性专业银行等。国际机构有亚洲开发银行、世界银行、美洲洲际开发银行等。

机构债券的利息支付频率差别很大，且税收条件因区别的债券而区别，流动性差异也有区别。某些机构债券只是私募发行，对投入者有限定。机构债券由于或多或少的与政府的关联，其信用质量高，但机构债券的流动性没有国债高，因此收益率高于国债。